Родился 3 мая 1965 года в Москве. В 1987-м вместе с однокашником из Московского финансового института открыл кооператив, занимавшийся производством "вареной" джинсовой ткани. В 1989 году был принят на должность начальника управления Международного банка экономического сотрудничества. В 1991 году однокурсник Прохорова, нынешний губернатор Красноярского края Александр Хлопонин познакомил его с владельцем внешнеэкономической ассоциации "Интеррос" Владимиром Потаниным. В 1992 году Потанин и Прохоров становятся равноправными партнерами, в 2007-м объявляют о разделе бизнеса, и Прохоров учреждает собственную группу ОНЭКСИМ.