Михаил Балакин родился 20 апреля 1961 в Серпухове, в семье строителей. В 1983 году окончил Московский инженерно-строительный институт им. В. В. Куйбышева по специальности «инженер-строитель». После окончания института распределился в управление № 204 треста «Мосфундаментстрой-1» Главмосстроя, где прошёл путь от мастера до главного инженера. В 1990 году был назначен директором Строительного управления № 155 Главмосстроя. В 1993 году, в процессе акционирования Строительного управления № 155 стал его совладельцем и генеральным директором. В 2000 году переходит на работу в Комплекс архитектуры, строительства, развития и реконструкции Москвы, где отвечал за строительство муниципальных объектов и реконструкцию ветхого жилого фонда. Во время его руководства Комплексом были возведены здание Дома музыки на Красных Холмах, новая сцена Большого театра, искусственный горнолыжный склон в Новопеределкине, здание библиотеки МГУ. В 2005 году, оставив по собственному желанию пост чиновника, вернулся к руководству своей компанией, где занимает пост Председателя совета директоров.